自有人類以來，“污穢”就不斷的現身騷擾著人世間的安穩和寧靜，為了對抗污穢，一群名為“陰陽師”的人們勇敢的站了出來，加入到了戰斗之中，用他們的智慧和勇氣守護著人類。少年焰魔堂轆轤（花江夏樹配音）立志要成為史上最強陰陽師，卻因為一場悲劇的發生而意識到災難的不可逆轉，遂放棄了理想，淪為路人。某日，一位名叫化野紅緒（潘惠美配音）的京都少女出現在了轆轤的身邊，兩人在誤打誤撞之中開始了同居生活。紅緒鏟除污穢的決心漸漸感化了轆轤，讓他再度看到了希望，燃起了熱血。與此同時，轆轤發現，紅緒的哥哥石鏡悠斗（村瀨步配音）和當年令自己失去一切的災難有著千絲萬縷的關聯。