《黑客帝國動畫版》由9段以《黑客帝國》系列電影世界觀為基礎(chǔ)生發(fā)出的短片組成，各篇的角度與風(fēng)格各異，制作班底匯聚了日本、美國、韓國三地的動畫精英。《機(jī)器復(fù)興》講述了MATRIX的歷史。機(jī)器人不堪人類惡劣對待，終于反抗并將人類化為能源。《少年故事》講述一名少年突然收到來自網(wǎng)絡(luò)的召喚，而大批黑衣人開始對他展開圍捕。《虛擬程序》展示了一對男女在虛擬訓(xùn)練程序中的片斷。《世界紀(jì)錄》描寫一位短跑運(yùn)動員在接近突破人類極限時(shí)終被系統(tǒng)牢牢控制。《超越極限》敘述因?yàn)橄到y(tǒng)錯(cuò)誤，平靜的街區(qū)中出現(xiàn)了一片超常區(qū)域。《偵探故事》描寫一位偵探被步步引領(lǐng)著試圖擺脫系統(tǒng)的桎梏。《矩陣化》講述一只機(jī)器人被人類捕獲并馴化的故事。《終極戰(zhàn)役》記錄了一艘飛船毀滅的經(jīng)過。